Residenza Sassi, 941, 20080 Basiglio
Microbioma16S
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Microbioma16S
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Residenza Sassi, 94120080 BasiglioRegione Lombardia
- 333 397 0569
Parole chiave
centri di apprendimento e tutorato
condizionatori d'aria
servizi di preparazione del terreno
farmaci
sostanze chimiche
sviluppatori e consulenti software
analisi cliniche e controlli medici
imprese lavori idrici
Descrizione di Microbioma16S
Web app per svolgere in modo intuitivo l'analisi dei dati di sequenziamento NGS da esperimenti di meta-barcoding del gene codificante per rRNA 16S relativi al microbioma batterico. Permette di eseguire una pipeline di analisi basata sul pacchetto Qiime2 con visualizzazione integrata dei risultati. Permette sia l'analisi secondaria dei dati grezzi (file fastq. gz da tecnologia MiSeq Illumina) per ottenere tabelle delle conte normalizzate delle OTUs/ASVs (Operational Taxonomic Units/Amplicon Sequence Variants) e della classificazione tassonomica, sia l'analisi terziaria delle tabelle di OTUs e tassonomia ed eventuali metadati per ottenere metriche di alfa e beta diversità e abbondanze relative dei taxa con figure pronte per la pubblicazione.
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